自民國88年本校成立系前身，自本系第21年的歷史，開始以護理管理系或護理管理系高級教育學院，民國94年的科技大學護理管理係以及相關係管理系評鑑所評鑑一等的優秀成績，與對本護理系的管理系評鑑一等的成功，與對本護理系的管理系進行管理，並取得一定的成果。並配合健康產業的發展趨勢以及促進健康觀念的推廣，自99學年起以「健康事業管理學位學程」繼續培養更符合健康產業需求的專業人才，102學年起更名為「健康事業管理系」，107學年增設碩士班。目前有碩士二日間部、和技日間部、學制四。
事業人才雙核心：健管健康=健康促進+經營管理（跨整合）。 二大就業領域：醫療產業、連鎖健康流通產業管理師。
健系教師能力強、教學技能強、業內專業管事經驗強，產學業能力強。
醫療帳務、疾病分類、健保申報、行銷企劃、創新服務設計、研究助理、市場調查與資料分析師等管理職務需才孔亟
雙核心+三個大學模組
碩班不易籌設，教育部仍准本系設置碩士班，顯見培育人才的教育品質與發展方向受肯定。
本系培養具「專業知能、職場倫理」特質之醫院等健康事業管理實務人才為教育目標。以健康與管理跨領域之雙專長知能為核心，培育學生成為